老友网【支线六】Abandoned Gym（可捉PM）
进到枯叶市废弃的电系道馆里能看到皮卡丘，走到尽头上面有个笔记，点击阅读。去紫苑镇的精灵塔埋葬皮卡丘的骨灰。
到了和被控制的绿爷打的那一楼，点击最大的坟墓触发剧情，出现了一个新的屋子。进去后触发剧情，点击中间的火后，火分裂成六个到周围的六个墓碑。点击墓碑，对战（可捕获尸体1-6号）。之后最上面又出现一间屋子，进去到最里面安葬皮卡丘。支线结束
【支线七Green’sTale 1 Chapter】
去紫苑镇的路上赤爷在想不知道绿爷现在怎么样了。出现回忆问你要不要玩绿的篇章，选择Yes，进入支线。
【支线八RelicBeast&支线三十二Dark Relic】（可捉PM）
12号道路东北方向有几座坟墓，正中间并排的三个站着一个老人，上去对话，老人说自己想知道古代城市毁灭的原因。触发支线。
获得道具DarkRelic（在12号道路）后，调查中间的墓碑如果赤爷听到有人说“DarkRelic”，恭喜你，支线可以继续下去。来到一个奇怪的世界，跟着提示逃到发光的地方出去。发现我们被吞到了超古代耿鬼的肚子里。屏幕前是超古代耿鬼和超古代胡地。一段对话后对耿鬼和胡地按A，LV40的Alaka Anc和Gengar Anc，可捕捉。对战结束后墓碑上出现一个PM球，此时去碰它不会触发任何剧情。需要过一段时间再去。
如果对精灵球按A有反应，则会出现支线的最后一段，赤爷听到一个声音，随后给予赤爷它的化身，超古代胖丁。（Lv40的Jiggly Anc）支线结束。
（注意，此支线触发的时间和现实时钟没有关系。因为我玩的时候没有开现实时钟。目前推测可能是推进几个游戏进度即可。）
【支线九Blue’sTale 1】
在玉虹市从小蓝（Blue）那里夺回徽章后会问你要不要进入蓝篇章。选择Yes触发支线。（13beat汉化版会黑屏，15.4我玩的时候没有问题）
【支线二十八 Secret of Joy】（可获得PM）
去金黄市（Saffron City）的PM中心，和乔伊（Joy）对话，又冲出来一个乔伊，他们之间产生了点矛盾。乔伊怒气冲冲走了，支线开启。去Saffron City Park（金黄市北面，金黄道馆西边）可以看到那个乔伊。和她对话，得知她叫Tiffany，已经不是护士了。然后知道现在的君沙和乔伊都是克隆人，乔伊的几个朋友被杀了，她要报仇，让赤爷帮忙。赤爷说自己不能杀人，乔伊说她自己在晚上杀了她们。
晚上的时候去金黄市的PC，进门前会触发剧情，让Tiffany知道虽然她们是克隆人但她们已经是人了，也有人的感情。Tiffany改变了主意，她把自己的吉利蛋（LV40的Chansey Nu，比普通的吉利蛋多了护士帽子）托付给了赤爷，告诉赤爷注意。支线结束。（没有明说Tiffany的结局，可能死了）
【一周目后去华蓝市东北部的Northern Cerulean Sector（和夏伯捉超梦的那里），进入第一个洞穴，走过中间两个水晶会触发一个剧情，似乎没算在支线里。一个超级Red，全队255级。注意就算打赢了也不要走中间的水晶出去，只要你走过这个水晶，就会触发这个Red。据说如果你找到这个Red去哪了就会拿到特殊服装，但我不知道他去哪了.jpg】